Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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