Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms