Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHDQ96IW2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms