Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms