Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms