Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms