Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-CQ95604 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms