Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRAT1Q92837 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms