Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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