Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms