Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ZNF548Q8NEK5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ZNF548Q8NEK5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ZNF548Q8NEK5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ZNF548Q8NEK5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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ZNF548Q8NEK5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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