Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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