Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms