Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms