Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms