Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IKBIPQ70UQ0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms