Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms