Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms