Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms