Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms