Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms