Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HOXA-AS3-202ENST00000518947 3992 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms