Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF628Q5EBL2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms