Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms