Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms