Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms