Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms