Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms