Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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