Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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RTN1Q16799 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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