Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms