Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXT1Q16394 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EXT1Q16394 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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EXT1Q16394 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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