Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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