Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms