Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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UBE3CQ15386 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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UBE3CQ15386 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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