Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRRQ15256 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms