Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC10A1Q14973 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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