Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms