Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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