Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CDH18Q13634 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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