Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms