Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms