Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCLQ13371 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms