Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PTPRSQ13332 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PTPRSQ13332 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRSQ13332 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRSQ13332 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRSQ13332 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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