Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHAF1BQ13112 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CHAF1BQ13112 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CHAF1BQ13112 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CHAF1BQ13112 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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