Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
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