Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIF5AQ12840 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF5AQ12840 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms