Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWF1Q12792 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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