Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms