Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms